223年，刘禅即位后，董允为黄门侍郎。243年，加辅国将军。244年，以侍中守尚书令，担任大将军费祎的副手。刘禅宠爱宦官黄皓，黄皓更想擅权专政，董允每每正颜厉色地匡谏刘禅，多次责备黄皓；黄皓十分惧怕董允，不敢为非作歹。当时，蜀人称诸葛亮、蒋琬、费祎及董允为“四相”。董允为官一生，两袖清风，淡泊名利。鉴于其政绩显著，很多蜀汉官员甚至连益州刺史蒋琬都上书刘禅，请给董允加官进爵，奖赏食邑，但均被董允拒绝。刘禅悄悄把整个分水镇划给董允名下，听说此事之后，董允一面上书刘禅，坚决不受，一面不分昼夜赶回分水镇，烧掉地契，将田地退给乡民。

246年董允去世。